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袖珍DNA测序仪实现随时随地准确测序

加拿大一组科学家发明了一种小巧便携的基因测序工具,方便研究人员带到实验室之外进行实地测序,比如可以随时随地检测COVID19基因,准确度是现有技术的一千多倍。袖珍DNA测序仪实现随时随地准确测序基因测序概念图。这份研究的作者之一加拿大英属哥伦比亚大学(University of British Columbia)的助理教授齐尔斯(Ryan Ziels)介绍说,牛津大学附属科技公司开发的MinION设备,是现有比较好用的一种便携式测序仪,但是它的出错率在5%~15%之间,而他们的新技术出错率只有不到0.5%。这份1月初发表在《自然-方法》(Nature Methods)期刊上的研究,采用了一种条形码系统,使得长读测序的准确度达到MinION这样系统的一千多倍。长读测序,又称第三代测序,可以同时测定1万到10万个碱基对之间的DNA长序列。这种新技术向目标分子加入条形码标记后,再使用常规的测序流程,包括扩增、复制目标分子等方法,最后得到结果。袖珍DNA测序仪实现随时随地准确测序研究称,使用条形码标记的方法便于把相关的DNA片段分组,能够测序的最长基因片段,是现有技术可以处理的长度的10倍。较长的基因片段,有助于判断细微的基因变异。齐尔斯说:“这个方法的一个好处在于,它适用于任何能够被扩增的基因。”该研究组把处理细节公布在共享空间内,供所有研究人员使用。“这种新方法对很多需要高准确度地测序长序列基因的领域非常有用,比如癌症研究、植物研究、人类基因和微菌科技等。”该研究组目前正和温哥华合作,把这种技术定制成可以随时随地检测城市供水和下水道污水内微菌的工具。及时了解城市供水系统内的微菌情况,对改善城市卫生和污水处理系统具有重要作用。

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